O Noviciado São João Batista Scalabrini, localizado em Passo Fundo, Rio Grande do Sul, desempenha um papel fundamental na formação dos Missionários de São Carlos (Scalabrinianos). O Noviciado é uma etapa da formação religiosa essencial para a preparação dos novos missionários, que fazem os votos de pobreza, castidade e obediência.

A cidade de Passo Fundo começou a fazer parte da história scalabriniana a partir de um convite realizado por Dom Cláudio Colling, em 1961, oferecendo à Congregação Scalabriniana o bairro Vera Cruz para ali fundar uma nova paróquia. O bairro era periférico. A então Província São Pedro assumiu a comunidade, enviando o Pe. Beniamino Basso em fevereiro de 1963 para iniciar a presença religiosa.

A alguns quilômetros da matriz, a Congregação adquiriu uma propriedade onde, em 1966, foi construído o Seminário Scalabrini, com a finalidade de acolher a etapa do noviciado. As atividades tiveram início em 22 de maio de 1967.

Inicialmente, chamava-se Seminário Pampa, passando, depois, a ser conhecido simplesmente como Seminário Scalabrini, em homenagem ao santo fundador, São João Batista Scalabrini.

Ao longo de sua história, de quase sessenta anos, acolheu, além do noviciado, o seminário menor, a filosofia e o postulantado e, mais recentemente, voltou a sediar o noviciado. Além de seminário, a estrutura também abrigou a Casa Provincial da antiga Província São Pedro.

Atualmente, em suas dependências funcionam o Noviciado São João Batista Scalabrini, o Postulado São Rafael, a Casa São José — desde 1990, destinada ao acolhimento de religiosos idosos e de todos os que necessitam de cuidados de saúde —, a Rede Scalabriniana de Comunicação e o Centro de Animação Vocacional.